В центре внимания сюжета третьего сезона "Секрета Харуки Ногидзаки" оказывается старый знакомый Аясэ Юто. Простой паренек ничем не отличается от многих других учеников своей старшей школы. Правда, его учебное заведение частное, поэтому здесь обучают будущих крутейших специалистов в своём деле. Главный персонаж же пока что похож на классического представителя серой массы. Вскоре всё изменится, ведь молодой человек окажется вплетен в загадочные и невероятные события, связанные со школьной принцессой Харуки Ногидзаки. Эта информация перевернёт жизнь молодого парня, который найдет себе новое призвание.