Бен уже юноша, ему "стукнуло " шестнадцать. Он учится в школе, играет в футбол.
Но старые недруги опять встают у него на пути. Исчез его дедушка. Теперь Бен должен разыскать дедушку и помочь ему. Бен и его сестра Гвен решают не терять времени даром и спешно отправляются в путь. Над планетой Земля нависла большая угроза, пришельцы с других миров готовятся атаковать и захватить Вселенную.Уничтожить всё живое. Спасти человечество одному чудо- мальчику не под силу, даже имея супер кристалл Омнитрикс. Чтобы добиться победы над инопланетным вторжением и сохранить человечество ему предстоит собрать воедино всех Пламеров и договариваться с бывшим врагом Кевином.